根据《国家税务总局关于完善关联申报和同期资料管理有关事项的公告》(国家税务总局公告2016年第42号)，实行查账征收的居民企业和在中国境内设立机构、场所并据实申报缴纳企业所得税的非居民企业向税务机关报送年度企业所得税纳税申报表时，应当就其与关联方之间的业务往来进行关联申报，这里说的是有关联交易的查账的关联企业申报，或是有国别通俗说是境外业务或企业的情况下报送。根据文件理解是分公司不用申报，但实务中存在独立核算的税务管理的分公司，此类情况建议询问下税局。

总公司代发分公司工资个税怎么申报

总公司代替分公司发放员工工资时，由分公司自行申报所属员工的个税，与分公司自行发放工资的操作一致，在实际取得的工资的申报期限内进行申报即可。只是分公司账上作为往来款项进行记录。

分公司能否代表总公司起诉

根据《民事诉讼法》第49条的规定，法人依法设立并领取营业执照的分支机构可以作为独立的民事诉讼主体。根据《公司法》第l4条规定，有限责任公司可以设立分公司，分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。

总公司给分公司拨款怎么入账

总公司拨款会计分录：

(1)总公司会计分录

借：其他应收款——分公司

贷：银行存款等

(2)分公司会计分录

借：银行存款等

贷：其他应付款——总公司

对公账户进出账不需要缴税，缴税是按收入的比例来缴纳的，但实际上很多企业是按发票金额缴税的。所以如果税局来查对公账户的进出账时，发现银行往来资料里存在不开票未缴税的收入信息时，就需要补缴税和缴纳罚款了，所以企业必须保证每笔进出款都要有依有据。